Почему в загран. паспорте имя сергей теперь пишется sergei,а не sergey?

Периодически правила транслитерации изменяются (у меня пятый загранпаспорт, и в них три варианта написания), поэтому всё правильно. но если вам необходимо какое-то конкретное написание (например, имеются другие важные документы, в которых ваши данные отличаются от современной транслитерации), то вам необходимо при подаче документов на оформление загранпаспорта приложить заявление с просьбой указать иное написание.