Чему может помешать наличие двух паспортов (гражданств)? например россии и германии?

Просто если человек совершил преступление на территории Германии и смотался в Россию, то Россия может выдать немецкого гражданина обратно. А вот гражданина России (хоть и с двойным гражданством) выдать не могут. Его будут судить в России. И наоборот. Действует конституционное правило о не выдачи своих граждан другим странам. Но если вы не собираетесь совершать какие-либо преступления, то и не заморачивайтесь. Предъявляете тот паспорт, который выгоден в конкретной ситуации )